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在密閉的體系內，CO2、HCO3－和CO32-的相對含量隨pH值的變化而變化，低pH值條件下，CO2占主要部分，在中等pH值范圍內，主要為HCO3-，高pH值范圍內，主要為CO32-。
由于RO膜可以脫除溶解性的離子而不能脫除溶解性的氣體，RO產水中的CO2含量與RO進水中CO2的含量基本相同，但是HCO3－和CO32—常常能夠減少1～2個數量級，這樣就會打破進水中CO2、HCO3－和CO32-之間的平衡，在系列反應中，CO2將與H2O結合發生如下反應平衡的轉移，直到建立新的平衡。CO2 + H2O ---HCO3－ + H+
如果進水中含有CO2，則RO膜元件的產水pH值總會降低，對于大多數RO系統反滲透產水的pH值將有1～2個pH值的下降，當進水堿度和HCO3－高時，產水的pH值下降就更大。
為數極少的進水，含較少的CO2、HCO3－或CO32-這樣看到產水pH值的變化就少。反滲透出水pH值偏低，加計量泵投加NaOH調節pH至堿性，因為當pH值介于7.5~8之間，反滲透的除鹽效果能達到最佳。
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