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這里說的膜污染指的是膜反應器在運行過程中所產生的增加膜阻力，造成膜處理效率低的原因。如廢水中的微粒、膠體粒子或溶質分子在膜表面沉淀、積累或在膜孔內吸附，堵塞膜孔。
那么，我們可以從哪些方面對膜污染進行防治呢？
1.從膜材料選擇上。
膜上污染物的存在是由于膜、溶劑、污染物之間相互作用的結果，除此之外膜表面性質和膜孔徑等因素也會造成影響。因此，根據污染物選擇膜材料可以有效地降低污染物對膜的損害。
選擇膜材料可以通過污水中的污染物所帶電荷與膜材料的親疏水性、機械強度、荷電性能、耐化學清洗性能及表面粗糙度等指標進行對比選擇。
2.優化膜清洗工藝
膜清洗法從基本上可以分為物理清洗和化學清洗。物理法通常是使用超聲波、氣水反沖洗和空氣反吹洗等方式進行清洗，但容易造成膜損傷。而化學清洗法則是利用酸堿和氧化劑對膜進行清洗，這種方法作用明顯，但存在二次污染的弊端。因此，在初階應用中，通常是將兩者結合起來使用。
3.膜污染清洗劑的選擇
膜清洗劑的選擇規則一般為：有機物用堿、無機物用酸、微生物用氧化劑，且多采用多種藥液輪流清洗。當膜污染嚴重時，酸、堿及氧化劑的輪流反復清洗也成為有效的手段，而采用專用膜清洗劑和專業的清洗方法，會使清洗的效果更加顯著。
